Windows2000/XP（NTは知らない）では、サービスとしてこれが利用できるので、PCの時計を正確にしておくためにこれを使えるようにしておきます。
Windows2000/XPでNTPを利用するための設定方法は、ZDNet JapanのHelpdesk「マシンの時刻を自動的にNTPサーバで合わせたい」が詳しいのでそちらを参照してください。

ProtcolはUDP、「いま何時？」「何時何分何秒」と問いかけと返事があるので方向は「Both」になります。WindowsXPの場合はサービス関連はとりあえずすべてsvchost.exeが代表して通信しているようなので、Applicaitionはこれになります。

NTPはポートが決まっています。123です。またNTPサーバのAddressも検索すればいろいろでてくるので、できるだけ近いところを選んで決め打ちしてください。
私は「Experimental NTP Servers」という通信総合研究所やNTTなどが行っている試行サービスを使いました。

このようなツールを使う場合は、Localポートを123ではなくて、1024-4999で指定しなければならないことがあります。

NTPの設定を作って、Logを残すようにし、実際にそのツールがどのポートから通信しに行ってるかを調べて、ポートの範囲を指定するようにするといいでしょう。